Unicamp lança ferramenta gratuita para análise de dados genéticos complexos

Pesquisadores da Universidade Estadual de Campinas (Unicamp), em colaboração com outras instituições, desenvolveram o CellForgeR, uma ferramenta online gratuita que simplifica a análise de informações genéticas complexas. O software é pioneiro no Brasil e tem o objetivo de permitir que cientistas, mesmo sem experiência em programação, analisem dados de expressão gênica em células individuais, impulsionando pesquisas nas áreas de saúde e biologia.

A tecnologia por trás do CellForgeR, o sequenciamento de RNA de célula única (single-cell RNA-seq), revolucionou o estudo de doenças como tumores e condições neurológicas. Diferente das técnicas tradicionais que analisam um conjunto de células, o single-cell RNA-seq identifica a atividade de genes em cada célula isoladamente. Essa granularidade permite descobertas inéditas, como a identificação de múltiplos estados celulares em macrófagos e adipócitos, que antes eram categorizados de forma mais simplificada.

Análise detalhada de células individuais

O professor Marcelo Mori, da Unicamp e um dos idealizadores do CellForgeR, explica que a metodologia possibilita uma visão sem precedentes das células. Ele compara o impacto da tecnologia ao que o microscópio eletrônico trouxe para a biologia, ao permitir maior definição e alterar a formulação de perguntas e hipóteses científicas. A capacidade de detalhamento é crucial para a compreensão aprofundada de doenças metabólicas e outras condições complexas.

A ferramenta foi projetada para ser intuitiva, com menus e botões que permitem aos pesquisadores selecionar parâmetros, tipos celulares e genes de interesse sem a necessidade de escrever qualquer linha de código. Essa abordagem visa democratizar o acesso a análises genéticas avançadas, que antes demandavam conhecimento especializado em bioinformática e acesso a computadores de alto desempenho.

Democratização do acesso e superação de barreiras

Diogo de Moraes, pesquisador da Universidade Estadual Paulista (Unesp) e co-criador do CellForgeR, ressalta a importância de criar ferramentas acessíveis no Brasil, inspirando-se em iniciativas internacionais. Ele destaca que, ao contrário de softwares tradicionais, o CellForgeR opera em um data center da Unicamp, o Cluster Científico do Instituto de Biologia, e pode ser acessado via navegador. Isso elimina a necessidade de instalação e de hardware potente, tornando a análise de dados de células únicas tão acessível quanto o uso de uma planilha eletrônica.

A expectativa é que o CellForgeR reduza o tempo e os recursos necessários para responder a perguntas científicas complexas. Um pesquisador interessado em câncer, por exemplo, poderá analisar rapidamente a expressão de genes em macrófagos tumorais e compará-la com outros tipos celulares. A iniciativa faz parte de uma estratégia maior do grupo para formar recursos humanos qualificados em pesquisa, capacitando cientistas nas técnicas de laboratório e na manipulação de dados de sequenciamento de células únicas, superando as barreiras técnicas e financeiras que limitam novas descobertas.

O desenvolvimento do CellForgeR contou com a colaboração de especialistas em bioinformática da Unicamp, Unesp e da Universidade de São Paulo (USP). O projeto também planeja a realização de treinamentos para cientistas interessados em aprofundar seus conhecimentos em single-cell RNA-seq.